東南大學(xué)是國家教育部直屬并與江蘇省共建的全國重點大學(xué)，國家“雙一流”、“211工程”、“985工程”、“卓越工程師教育培養(yǎng)計劃”和“111計劃”重點建設(shè)的名牌大學(xué)，“卓越聯(lián)盟”主要成員，中國一流大學(xué)，中國五星級大學(xué)。2017年，東南大學(xué)入選世界一流大學(xué)建設(shè)A類高校名單。
自1952年全國高校院系調(diào)整后，東南大學(xué)就開始招收研究生，20世紀(jì)50年代后期至60年代初期共招收研究生117人，1978年恢復(fù)招收研究生。1981年實施學(xué)位條例后，首批獲學(xué)士、碩士、博士學(xué)位授予權(quán)；首批建有博士后流動站的單位；首批進(jìn)入國家“985工程”和“211工程”；2017年進(jìn)入一流大學(xué)建設(shè)高校A類名單；是自行審批博士和碩士學(xué)位授予權(quán)、自行審定增列博士生指導(dǎo)教師的試點單位；首批獲準(zhǔn)招收和培養(yǎng)工程碩士生；首批獲準(zhǔn)開展工程博士專業(yè)學(xué)位授予工作。1986年4月經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn)試辦研究生院，1996年3月經(jīng)國家教委批準(zhǔn)，正式建立研究生院。東南大學(xué)與國內(nèi)許多重點高校一樣，已成為我國研究生教育與培養(yǎng)的一個重要基地。
現(xiàn)有37個博士學(xué)位授權(quán)一級學(xué)科點，49個碩士學(xué)位授權(quán)一級學(xué)科點，覆蓋了哲學(xué)、經(jīng)濟學(xué)、法學(xué)、教育學(xué)、文學(xué)、理學(xué)、工學(xué)、醫(yī)學(xué)、管理學(xué)、藝術(shù)學(xué)等多個學(xué)科。
在東南大學(xué)創(chuàng)建世界一流大學(xué)發(fā)展目標(biāo)的驅(qū)動下，學(xué)校的優(yōu)勢學(xué)科確立了以世界一流學(xué)科為標(biāo)桿建設(shè)高峰學(xué)科的目標(biāo)，學(xué)科建設(shè)水平得到了整體提升。工程學(xué)、計算機科學(xué)、材料科學(xué)、數(shù)學(xué)、物理學(xué)、化學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、生物學(xué)與生物化學(xué)、藥理學(xué)與毒理學(xué)、神經(jīng)科學(xué)與行為科學(xué)、社會科學(xué)總論、環(huán)境科學(xué)與生態(tài)學(xué)、其中工程學(xué)列15位，進(jìn)入ESI世界前萬分之一，計算機科學(xué)列11位，進(jìn)入ESI世界前千分之一。
經(jīng)過“985工程”、“211工程”、江蘇高校優(yōu)勢學(xué)科建設(shè)工程和“雙一流”的重點建設(shè)，東南大學(xué)學(xué)科結(jié)構(gòu)不斷完善、學(xué)科競爭力持續(xù)提升。2017年9月，學(xué)校進(jìn)入一流大學(xué)建設(shè)高校A類名單，11個學(xué)科入選一流學(xué)科名單，包括：材料科學(xué)與工程、電子科學(xué)與技術(shù)、信息與通信工程、控制科學(xué)與工程、計算機科學(xué)與技術(shù)、建筑學(xué)、土木工程、交通運輸工程、生物醫(yī)學(xué)工程、風(fēng)景園林學(xué)、藝術(shù)學(xué)理論等，入選學(xué)科數(shù)位列全國第8。
在教育部學(xué)位與研究生教育發(fā)展中心組織的第四輪學(xué)科評估中，獲得A+的學(xué)科5個，分別為建筑學(xué)、土木工程、交通運輸工程、生物醫(yī)學(xué)工程、藝術(shù)學(xué)理論，獲得A+的學(xué)科數(shù)并列全國高校第8位。
校標(biāo)：1、東南大學(xué)校標(biāo)于1997年5月由東南大學(xué)藝術(shù)學(xué)系張道一教授設(shè)計完成。
2、校標(biāo)整體圖案呈圓形，由兩個同心圓組成。外環(huán)線條用外粗內(nèi)細(xì)“文武線”裝飾，體現(xiàn)了中國的傳統(tǒng)文化。外環(huán)上半部分為東南大學(xué)英文名稱“SOUTHEAST UNIVERSITY”，下半部分為集王羲之書法體校訓(xùn)“止于至善”。
3、標(biāo)識中間主體部分延續(xù)了中央大學(xué)時期?；盏牡谷菆D形。倒三角形內(nèi)部為東南大學(xué)的標(biāo)志性建筑四牌樓校區(qū)大禮堂。細(xì)線為大禮堂輪廓線，中間黑實線為大禮堂正立面愛奧尼亞柱式和山花構(gòu)圖。內(nèi)部等腰三角形的下面一角沖破內(nèi)圓，含“遵守規(guī)則又敢于創(chuàng)新”之深意。內(nèi)圈的三角形和外圈的圓形分別代表東南大學(xué)的歷史與現(xiàn)實、舊我與新我。兩者的配合，既體現(xiàn)出形式上相反相成的互滲與融合，也凸現(xiàn)出歷史與現(xiàn)實、舊我與新我之間的張力，預(yù)示了東南大學(xué)無限美好的輝煌的未來。
4、內(nèi)圓中還有被三角形分割成的三個弓形區(qū)域，上方標(biāo)明校名“東南大學(xué)”，也為集王羲之書法體；下方左側(cè)“1902”， 表明學(xué)校的歷史源遠(yuǎn)流長，可以追溯到1902年張之洞等創(chuàng)辦的三江師范學(xué)堂；下方右側(cè)“南京”，表明學(xué)校的辦學(xué)地點。
5、校標(biāo)的顏色選取黃色和綠色。外環(huán)和大禮堂為黃色，三角形內(nèi)大禮堂背景為綠色。黃色是中國的傳統(tǒng)色，同時也表明該校校址曾是六朝皇宮內(nèi)苑和國子監(jiān)所在地。綠色喻意青年學(xué)子風(fēng)華正茂，代表六朝松歷經(jīng)千年仍然生機勃勃旺盛生命力，同時表明該校位于長江之濱、玄武湖畔。
校訓(xùn)：止于至善
東南大學(xué)校訓(xùn)典出《禮記·大學(xué)》，此篇開篇即說：“大學(xué)之道，在明明德，在親民，在止于至善?！边@里的“大學(xué)”，當(dāng)時是針對“小學(xué)”而言的，“小學(xué)”即禮、樂、射、御、書、數(shù)，屬于“藝”的層面，稱六藝，而“大學(xué)”是修身之學(xué)，使人成為道德上的完人之學(xué)，屬于“道”的層面。道和藝，一為形而上，為體，為性，一為形而下，為用，為相。朱熹稱“大學(xué)”為“大人之學(xué)”（《四書集注·大學(xué)章句》），也是恰當(dāng)?shù)?，“大人”指道德完善之人?/p>
對于“止于至善”四字，孔穎達(dá)釋為“言大學(xué)之道在止處于至善之行。”（《禮記正義》）朱熹釋“止”為“必止于是而不遷”，一定要達(dá)到這個境界而不再改變，釋“至善”為“事理當(dāng)然之極”（《四書集注·大學(xué)章句》），事情的最高原則，即最高的善。王陽明釋“至善”為“性”，即本性，人類的本生是純善無惡的，“至善者，性也。性元無一毫之惡，故曰至善。”（《傳習(xí)錄上·語錄一》）至善之性是人類的固有本性，所以“止”就是一種對本性的復(fù)歸，“止之，是復(fù)其本然而已?！?/p>
1978年，南京工學(xué)院恢復(fù)招收研究生。
1981年實施學(xué)位條例后，首批獲學(xué)士、碩士、博士學(xué)位授予權(quán)。
1982年，南京工學(xué)院舉辦建校30周年校慶。
1986年4月，經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn)試辦研究生院。
1988年5月，南京工學(xué)院更名為東南大學(xué)，開始由工科大學(xué)向以理工科為主的綜合性大學(xué)轉(zhuǎn)變。同年12月，東大浦口校區(qū)奠基，并于1990年9月投入使用。
1991年，東大作為國家教委的改革試點，在全國高校中率先進(jìn)行了校內(nèi)管理體制改革。
1993年，東大又在全國高校中最先進(jìn)行招生及獎學(xué)金制度的改革。
1999年，入選第一批國家大學(xué)生文化素質(zhì)教育基地。
1996年3月，經(jīng)國家教委批準(zhǔn)，正式建立研究生院。12月，東南大學(xué)入選首批“211工程”重點建設(shè)高校。
2000年4月，原東南大學(xué)、南京鐵道醫(yī)學(xué)院、南京交通高等?？茖W(xué)校合并，南京地質(zhì)學(xué)校并入，組建了新的東南大學(xué)。
2001年2月，東南大學(xué)被列入國家“985工程”重點建設(shè)高校。12月，首批獲準(zhǔn)試辦國家示范性軟件學(xué)院。
2006年，占地3700畝的九龍湖校區(qū)投入使用，浦口校區(qū)被用作東南大學(xué)成賢學(xué)院校址。同年，入選國家“111計劃”。
2007年，入選“國家大學(xué)生創(chuàng)新性實驗計劃”首批實施高校。同年， 成為研究生培養(yǎng)機制改革17所首批試點高校之一。
2010年，入選教育部“卓越工程師教育培養(yǎng)計劃”首批實施高校。 2012年，入選教育部、衛(wèi)生部第一批“卓越醫(yī)生教育培養(yǎng)計劃”項目試點高校。
2014年，入選國家“2011計劃”牽頭高校。同年，被教育部評為全國畢業(yè)生就業(yè)典型經(jīng)驗高校。
2016年，國家國防科技工業(yè)局與教育部確定共建東南大學(xué)。
2017年1月，被教育部認(rèn)定為全國首批深化創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)教育改革示范高校。5月 ，加入中英大學(xué)工程教育與研究聯(lián)盟。9月，成為首批一流網(wǎng)絡(luò)安全學(xué)院建設(shè)示范項目高校；同月，東南大學(xué)入選國家“雙一流”建設(shè)高校。11月，學(xué)校與中國航天科工集團(tuán)公司簽署戰(zhàn)略合作協(xié)議。
2018年10月，東南大學(xué)與中國電子科技集團(tuán)公司電子科學(xué)研究院簽署戰(zhàn)略合作協(xié)議。11月，學(xué)校與聯(lián)合國教科文組織簽署合作框架協(xié)議；同月，入選教育部第一批中華優(yōu)秀傳統(tǒng)文化傳承基地。
2019年1月10日，東南大學(xué)發(fā)布了2019年的“1號”文件，決定在人文學(xué)院成立歷史學(xué)系。1月14日，東南大學(xué)人工智能學(xué)院、人工智能研究院揭牌成立。2月，被教育部認(rèn)定為首批高等學(xué)?？萍汲晒D(zhuǎn)化和技術(shù)轉(zhuǎn)移基地。5月，被國務(wù)院學(xué)位委員會批準(zhǔn)為學(xué)位授權(quán)自主審核單位。9月，成為中國人工智能教育聯(lián)席會創(chuàng)始成員、理事單位。10月，江蘇省高校生物學(xué)學(xué)科聯(lián)盟在東南大學(xué)成立，東南大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院揭牌。
2020年7月，入選第二批高校國家知識產(chǎn)權(quán)信息服務(wù)中心建設(shè)名單。9月，入選健康扶貧聯(lián)盟。10月20日，加入“城鄉(xiāng)規(guī)劃扶貧聯(lián)盟”；同月，被國家知識產(chǎn)權(quán)局、 教育部確定為2020年度國家知識產(chǎn)權(quán)示范高校。
2021年1月，東南大學(xué)、南京醫(yī)科大學(xué)、多倫多大學(xué)、大學(xué)健康網(wǎng)絡(luò)（UHN）舉行四方合作協(xié)議線上簽約儀式。4月23日，發(fā)起組建“長三角可持續(xù)發(fā)展大學(xué)聯(lián)盟”。5月15日，東南大學(xué)橋梁研究中心揭牌。
2021年5月，入選教育部辦公廳公布的首批未來技術(shù)學(xué)院名單。6月17日下午，東南大學(xué)-中國移動研究院聯(lián)合創(chuàng)新中心揭牌暨首批課題啟動儀式在九龍湖校區(qū)舉行。12月17日，東南大學(xué)與南京市人民政府、華為技術(shù)有限公司舉辦簽約儀式，深入開展運動健康領(lǐng)域合作。
2022年2月14日，入選教育部公布的第二輪“雙一流”建設(shè)高校及建設(shè)學(xué)科名單。7月30日，江蘇國家應(yīng)用數(shù)學(xué)（東南大學(xué)）中心揭牌儀式在江蘇南京舉行。
2023年1月12日，共同發(fā)起成立的卓越大學(xué)智庫聯(lián)盟成立大會召開。
2023年6月6日，東南大學(xué)國家卓越工程師學(xué)院揭牌。
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