該廟坐北朝南,一進院落,南北長49.8米,東西寬25.5米,占地面積為1254.96平方米。中軸線上依次為山門、獻廳、正殿,東西兩側分布有垛樓、廊廡、配殿、耳殿。
小會嶺二仙廟獻廳為清代建筑,臺基高0.41米,面闊三間,進深一間,單檐卷棚頂。前檐柱頭斗拱把頭交項作,后檐為荷葉墩。梁架結構為六架梁通達前后檐,通檐用二柱,未設門窗,前后敞廊。
正殿面闊三間(7.75米),進深六椽(7.45米),平面呈方形,單檐歇山頂。屋頂舉折平緩,出檐深遠。檐下柱頭斗拱五鋪作,單抄單下昂,補間斗拱五鋪作,雙抄雙下昂。梁架結構簡潔嚴謹,用材粗大。門窗形制為明間設四扇六抹頭格扇門,次間設門兩扇,亦為六抹頭格扇門,顯為后人改制,但原有榫卯仍可尋見。整個殿宇的建筑形制、結構手法明顯帶有宋代建筑風格。
對于小會嶺二仙廟的創(chuàng)建年代,各種資料頗有爭議,很多資料顯示建廟時期“不詳”,但也有人說,它是山西東南部太行山封頂早的一處古代建筑。