腔棘魚(yú)最早出現(xiàn)于3.77億年前,腔棘魚(yú)化石則多發(fā)現(xiàn)于二疊紀(jì)末期到白堊紀(jì)早期。腔棘魚(yú)屬與其他同類(lèi)魚(yú)一樣,骨化程度較低,這是世界上現(xiàn)今存活當(dāng)中的最古老魚(yú)類(lèi),在1930年代被漁民捕獲兩條之前,都以為這種魚(yú)已經(jīng)滅絕了??茖W(xué)家本來(lái)也認(rèn)為腔棘魚(yú)只生活在非洲東部,但是在1997年于印尼蘇拉威西島發(fā)現(xiàn)了另一近緣種。2007年5月16日在桑給巴爾位于東非坦桑尼亞?wèn)|部一個(gè)島上的沿海城市,漁夫捕獲了一條腔棘魚(yú),這條腔棘魚(yú)在一家瀕海餐館的魚(yú)池內(nèi)存活了十七個(gè)小時(shí)。
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