1976年5月，參加工作。
1978年，考入南通醫(yī)學院（現(xiàn)南通大學醫(yī)學院）醫(yī)學院臨床醫(yī)學專業(yè)，
1983年，從南通醫(yī)學院畢業(yè)，獲得學士學位。
1987年2月，加入中國共產(chǎn)黨。
1988年，從南京鐵道醫(yī)學院（現(xiàn)東南大學醫(yī)學院）畢業(yè)，獲得碩士學位，
1995年，從上海醫(yī)科大學（現(xiàn)復旦大學上海醫(yī)學院）畢業(yè)，獲得醫(yī)學博士學位。
1997年，首批入選“上海市衛(wèi)生系統(tǒng)百名跨世紀優(yōu)秀學科帶頭人培養(yǎng)計劃”。
1999年至2000年，以高級訪問學者身份赴美國匹茲堡大學移植中心從事肝移植及肝臟外科臨床研究。
2005年，入選“上海市醫(yī)學領軍人才培養(yǎng)計劃”及“上海市百名領軍人才培養(yǎng)計劃”。
2013年12月，擔任復旦大學附屬中山醫(yī)院院長、肝外科主任、復旦大學器官移植中心副主任、復旦大學上海醫(yī)學院腫瘤學系副主任、上海市肝腫瘤臨床醫(yī)學中心副主任。
2019年2月16日，在復旦中山廈門醫(yī)院成立樊嘉院士名醫(yī)工作室。
2016年10月，獲得何梁何利基金科學與技術進步獎。
2016年11月，獲得第九屆談家楨生命科學臨床醫(yī)學獎。
2017年11月，當選中國科學院院士，隸屬于生命科學和醫(yī)學學部。
復旦大學附屬中山醫(yī)院院長
復旦大學附屬中山醫(yī)院腫瘤防治中心主任
復旦大學肝癌研究所常務副所長
復旦大學器官移植中心主任
上海市肝腫瘤臨床醫(yī)學中心主任
上海市肝病研究所所長
中國醫(yī)師協(xié)會外科醫(yī)師分會肝臟外科醫(yī)師委員會主任委員
中國抗癌協(xié)會肝癌專業(yè)委員會前任主任委員
中國臨床腫瘤學會肝癌專家委員會副主任委員
第三屆中國抗癌協(xié)會醫(yī)院管理分會副主任委員
上海市醫(yī)學會外科?？品謺魅挝瘑T
上海市醫(yī)學會腫瘤分會副主任委員
上海市抗癌協(xié)會副理事
上海市醫(yī)學會器官移植分會委員
中華醫(yī)學會腫瘤分會常委
中華醫(yī)學會腫瘤學分會主任委員
中華醫(yī)學會常務理事
中華外科學會肝臟學組委員
中國抗癌協(xié)會肝癌專業(yè)委員會副主任委員
中國抗癌協(xié)會常務理事
上海市抗癌協(xié)會副理事長
上海市醫(yī)學會腫瘤分會副主任委員
上海市醫(yī)學會器官移植分會委員
美國臨床腫瘤學會（ASCO）會員
美國臨床外科學會（SSO）會員及國際肝膽胰協(xié)會委員
《中華外科雜志》、《中華肝膽外科雜志》、《中華實驗外科雜志》《中華消化外科雜志》、《中國實用外科雜志》、《肝膽胰外科雜志》、《腹部外科雜志》、《外科理論與實踐雜志》、《肝膽外科雜志》、《消化外科雜志》、《中國臨床醫(yī)學雜志》等15本雜志副主編、編委
