職業(yè)生涯

1994年，參加全國青少年錦標賽，獲得個人首個男單冠軍，并被中國乒乓球男隊主教練蔡振華看中，進入國家二隊。

1996年，參加乒乓球亞洲杯比賽，獲得男單項目冠軍，同年，進入中國國家乒乓球一隊，師從吳敬平教練。

1997年10月，參加第八屆全運會，在男團項目、男單項目中獲得冠軍。

1998年６月，參加馬來西亞乒乓球公開賽，獲男單冠軍。同月，參加在日本舉行的“荻村杯”全日本乒乓球公開賽，獲男雙冠軍。參加第十四屆亞洲乒乓球錦標賽，與隊友合作，獲男子團體冠軍，與劉國梁合作，獲男雙冠軍。參加第十四屆亞洲乒乓球錦標賽，獲男子團體冠軍，獲男雙冠軍。

1999年1月，參加國際乒乓球職業(yè)巡回賽總決賽，獲男雙亞軍。同年，參加第45屆世界乒乓球錦標賽，男單項目中，收獲亞軍?；祀p項目中，收獲個人第一個世界冠軍。

2000年，首次參加世乒賽團體賽，獲得亞軍。同年，參加第21屆乒乓球世界杯，決賽中，以3-0戰(zhàn)勝金澤洙，收獲冠軍。

2001年，參加大阪世乒賽，在男團決賽中獲得世乒賽男團冠軍。同年，還獲得國際乒聯(lián)巡回賽總決賽男單冠軍。

2002年，參加國際乒聯(lián)職業(yè)巡回賽總決賽，男雙項目中，獲得冠軍。

5月，參加第47屆世乒賽，混雙項目中，奪得混雙赫杜塞克杯。10月，參加乒乓球世界杯，男單項目中，獲得世界冠軍。12月，出戰(zhàn)國際乒聯(lián)巡回賽總決賽男雙項目上，奪得冠軍。

2004年3月，參加第47屆世乒賽男團決賽，獲得男團項目冠軍。8月，參加雅典奧運會，男雙項目中，獲得個人首枚奧運會金牌。10月，參加2004年乒乓球世界杯比賽，成功衛(wèi)冕。12月，參加國際乒聯(lián)職業(yè)巡回賽總決賽，男雙項目中，獲得冠軍。

2006年5月，參加第48屆世乒賽男團決賽，實現(xiàn)世乒賽男團三連冠。10月在乒乓球男子世界杯男單決賽中，獲得世界杯冠軍。12月，出戰(zhàn)多哈亞運會，男團決賽中，獲得男團項目冠軍。單項項目中，獲得混雙冠軍。

2007年5月，參加第49屆乒乓球世錦賽，男雙決賽中，職業(yè)生涯首度獲得世乒賽男雙冠軍。10月，跟隨中國隊奪得第5屆乒乓球世界杯男團項目冠軍。12月，參加國際乒聯(lián)巡回賽總決賽，男單決賽中，獲得冠軍。

2008年3月，參加第49屆世乒賽團體賽，獲得冠軍。8月，北京奧運會乒乓球男團決賽中，獲得男團項目金牌。男單項目中，收獲個人職業(yè)生涯首枚奧運會男單金牌。

2010年5月，參加世乒賽男團決賽，獲得男團冠軍。11月，參加廣州亞運會，奪得男團冠軍。

2011年8月，入選國際乒聯(lián)名人堂。

2012年，參加第20屆亞洲乒乓球錦標賽，獲得男團冠軍。

2014年8月，正式宣布退役。

教練時期

2014年5月，出任廣東省乒乓球隊總教練。

2017年4月，重返國家隊，擔任國乒男一隊教練員

2019年2月，出任國乒女一隊組長。

2021年，第一次帶隊參加奧運會，除指導(dǎo)劉詩雯和陳夢外，還擔任混雙項目主管教練。在女單項目中，弟子陳夢首次奪得奧運會冠軍。

2022年12月，正式成為中國國家女子乒乓球隊主教練。

2024年7月13日，擔任巴黎奧運會中國體育代表團乒乓球項目教練。

獲獎記錄

奧運會

2008年，北京奧運會男子團體冠軍。

2008年，北京奧運會男子單打冠軍。

2004年，雅典奧運會男子雙打冠軍。

世乒賽

2013年，單項世乒賽男子雙打亞軍。

2012年，團體世乒賽男子團體冠軍。

2011年，單項世乒賽男子雙打亞軍。

2010年，團體世乒賽男子團體冠軍。

2008年，團體世乒賽男子團體冠軍。

2007年，單項世乒賽混合雙打亞軍。

2007年，單項世乒賽男子單打亞軍。

2007年，單項世乒賽男子雙打冠軍。

2006年，團體世乒賽男子團體冠軍。

2005年，單項世乒賽男子單打亞軍。

2004年，團體世乒賽男子團體冠軍。

2003年，單項世乒賽混合雙打冠軍。

2001年，世乒賽男子團體冠軍。

2000年，世乒賽男子團體亞軍。

1999年，世乒賽男子單打亞軍。

1999年，世乒賽混合雙打冠軍。

世界杯

2011年，乒乓球世界杯男子團體冠軍。

2007年，乒乓球世界杯男子團體冠軍。

2006年，乒乓球世界杯男子單打冠軍。

2004年，乒乓球世界杯男子單打冠軍。

2003年，乒乓球世界杯男子單打冠軍。

2000年，乒乓球世界杯男子單打冠軍。

人物評價

馬琳是現(xiàn)役國手中打球最善于動腦子的選手，對手的奇招往往堅持不了多久就被他的新策略擊退。（中國新聞網(wǎng) 評）

馬琳是那種想的很多的人，對冠軍很要的人，但是相比王皓，馬琳大氣不足。馬琳是個想的很細的人，有時候他可能比我們教練組都要想得多。所以在管理馬琳的過程中是非常有意思的，感覺你是在和他博弈，某種程度上需要教練和他斗智斗勇，得有點水平，有些技巧。有些話是要點給他，有些話是要刺激他的。（國乒主教練劉國梁 評）

打球方面，馬琳悟性最好，他對球、對對手琢磨的很透。馬琳技術(shù)上幾乎只靠正手，所以他能這么多年一直站在世界超一流選手之列，如果沒有過人的智慧還有過硬的心理素質(zhì)是絕對不可能的。（中國乒乓球隊男隊教練吳敬平 評）