1989年,參加全國少年乒乓球賽和亞洲少年乒乓球賽,均奪得男子單打冠軍。
1991年,拿下全國乒乓球錦標賽男子團體冠軍,并調入國家乒乓球一隊。
1994年1月,參加第二屆世界乒乓球青年錦標賽,獲得男單、男團兩項冠軍。
1994年9月,在第十二屆亞洲乒乓球錦標賽獲得男單項目冠軍、混雙冠軍,男團項目中,幫助中國隊奪冠,實現個人“三冠王”。10月,參加日本廣島亞運會,獲得男子團體冠軍、混雙冠軍。
1995年5月,參加第43屆世乒賽,幫助中國隊奪得男子團體冠軍,男單項目中奪冠,職業(yè)生涯第一次捧起世界冠軍獎杯。
1995年10月,參加在法國舉辦的乒乓球世界杯,奪得男單冠軍。
1996年7月,參加第26屆奧運會,乒乓球男雙決賽中,奪得冠軍,收獲個人首枚奧運金牌。同年,還獲得首屆國際乒聯(lián)職業(yè)巡回賽男單冠軍和亞洲乒乓球錦標賽男單、男雙冠軍。
1997年4月,參加第44屆世界乒乓球錦標賽,獲得男團冠軍、混雙亞軍和男雙冠軍。同年,還獲得國際乒聯(lián)總決賽男單冠軍。
1998年,參加第十三屆曼谷亞運會乒乓球比賽,奪得男團冠軍、男雙冠軍。
1999年,拿下第45屆世乒賽男雙冠軍和亞洲12強賽冠軍,在國際乒聯(lián)總決賽中,獲得男雙冠軍、男單亞軍。
2000年9月,參加悉尼奧運會,在男單項目中獲得金牌,并完成男單世界冠軍“大滿貫”偉業(yè)。
2001年,參加第46屆世乒賽,獲得男團冠軍,男單、男雙亞軍。
2004年,在第47屆世乒賽中獲得男團冠軍。
2005年,參加第48屆世乒賽,收獲男雙冠軍。
2006年,宣布退役。
2006年10月,參加國家隊乒乓球一隊教練員述職,正式開啟教練員生涯。
2007年1月,正式分管郭躍和劉詩雯,成為4名選手的主管教練。在女團項目中,弟子郭躍與張怡寧和王楠一起,拿到奧運女團冠軍。
2013年2月,出任女隊主教練。并贏得上任后首個世界冠軍。
2014年,帶領中國女隊取得24戰(zhàn)全勝的戰(zhàn)績,拿到團體世錦賽冠軍,并獲得2014年國際乒聯(lián)年度最佳教練提名。
2016年,里約奧運會,帶領中國女隊獲得乒乓球女子團體冠軍,女單項目上,丁寧戰(zhàn)勝李曉霞獲得冠軍,中國隊包攬金、銀牌。
2000年,悉尼奧運會男子單打冠軍。
2000年,悉尼奧運會男子雙打亞軍。
1996年,亞特蘭大奧運會男子雙打冠軍。
2005年,第48屆世乒賽男子雙打冠軍。
2003年,第47屆世乒賽男子雙打亞軍。
2001年,第46屆世乒賽男子單打亞軍。
2001年,第46屆世乒賽男子雙打亞軍。
2001年,第46屆世乒賽男子團體冠軍。
2000年,第45屆世乒賽男子團體亞軍。
1999年,第45屆世乒賽男子雙打冠軍。
1997年,第44屆世乒賽男子團體冠軍。
1997年,第44屆世乒賽男子雙打冠軍。
1997年,第44屆世乒賽混雙亞軍。
1995年,第43屆世乒賽男子團體冠軍。
1995年,第43屆世乒賽男子單打冠軍。
2002年,第23屆男子世界杯男子單打亞軍。
1997年,第18屆男子世界杯男子單打亞軍。
1995年,第16屆男子世界杯男子單打冠軍。
他非常固執(zhí),好的地方就是追求執(zhí)著,對事業(yè)很執(zhí)著。但他固執(zhí)的另一面,是一般的東西,他不太容易接受。我們有時候也很頭疼,有時候心里在罵街,恨不得,怎么這么不開竅?(中國乒乓球隊總教練蔡振華評)
我感覺他人比較固執(zhí),就是他認準的一樣東西,你很難去改變他。(中國乒乓球男隊主教練劉國梁評)
孔令輝的退役意味著一個時代的結束,不過退得太早了些,很惋惜啊。(前國家隊總教練許紹發(fā)評)
輝哥是一個非常成功的乒乓球運動員,我希望他早點娶妻生子,在以后的事業(yè)上,同樣成為一個成功的男人。(中國男子乒乓球運動員王皓評)
他平時是一個能扛,能沉得住氣,心里很有想法的人。(中國男子乒乓球運動員劉國正評)