1989年,參加全國(guó)少年乒乓球賽和亞洲少年乒乓球賽,均奪得男子單打冠軍。
1991年,拿下全國(guó)乒乓球錦標(biāo)賽男子團(tuán)體冠軍,并調(diào)入國(guó)家乒乓球一隊(duì)。
1994年1月,參加第二屆世界乒乓球青年錦標(biāo)賽,獲得男單、男團(tuán)兩項(xiàng)冠軍。
1994年9月,在第十二屆亞洲乒乓球錦標(biāo)賽獲得男單項(xiàng)目冠軍、混雙冠軍,男團(tuán)項(xiàng)目中,幫助中國(guó)隊(duì)奪冠,實(shí)現(xiàn)個(gè)人“三冠王”。10月,參加日本廣島亞運(yùn)會(huì),獲得男子團(tuán)體冠軍、混雙冠軍。
1995年5月,參加第43屆世乒賽,幫助中國(guó)隊(duì)奪得男子團(tuán)體冠軍,男單項(xiàng)目中奪冠,職業(yè)生涯第一次捧起世界冠軍獎(jiǎng)杯。
1995年10月,參加在法國(guó)舉辦的乒乓球世界杯,奪得男單冠軍。
1996年7月,參加第26屆奧運(yùn)會(huì),乒乓球男雙決賽中,奪得冠軍,收獲個(gè)人首枚奧運(yùn)金牌。同年,還獲得首屆國(guó)際乒聯(lián)職業(yè)巡回賽男單冠軍和亞洲乒乓球錦標(biāo)賽男單、男雙冠軍。
1997年4月,參加第44屆世界乒乓球錦標(biāo)賽,獲得男團(tuán)冠軍、混雙亞軍和男雙冠軍。同年,還獲得國(guó)際乒聯(lián)總決賽男單冠軍。
1998年,參加第十三屆曼谷亞運(yùn)會(huì)乒乓球比賽,奪得男團(tuán)冠軍、男雙冠軍。
1999年,拿下第45屆世乒賽男雙冠軍和亞洲12強(qiáng)賽冠軍,在國(guó)際乒聯(lián)總決賽中,獲得男雙冠軍、男單亞軍。
2000年9月,參加悉尼奧運(yùn)會(huì),在男單項(xiàng)目中獲得金牌,并完成男單世界冠軍“大滿(mǎn)貫”偉業(yè)。
2001年,參加第46屆世乒賽,獲得男團(tuán)冠軍,男單、男雙亞軍。
2004年,在第47屆世乒賽中獲得男團(tuán)冠軍。
2005年,參加第48屆世乒賽,收獲男雙冠軍。
2006年,宣布退役。
2006年10月,參加國(guó)家隊(duì)乒乓球一隊(duì)教練員述職,正式開(kāi)啟教練員生涯。
2007年1月,正式分管郭躍和劉詩(shī)雯,成為4名選手的主管教練。在女團(tuán)項(xiàng)目中,弟子郭躍與張怡寧和王楠一起,拿到奧運(yùn)女團(tuán)冠軍。
2013年2月,出任女隊(duì)主教練。并贏得上任后首個(gè)世界冠軍。
2014年,帶領(lǐng)中國(guó)女隊(duì)取得24戰(zhàn)全勝的戰(zhàn)績(jī),拿到團(tuán)體世錦賽冠軍,并獲得2014年國(guó)際乒聯(lián)年度最佳教練提名。
2016年,里約奧運(yùn)會(huì),帶領(lǐng)中國(guó)女隊(duì)獲得乒乓球女子團(tuán)體冠軍,女單項(xiàng)目上,丁寧戰(zhàn)勝李曉霞獲得冠軍,中國(guó)隊(duì)包攬金、銀牌。
2000年,悉尼奧運(yùn)會(huì)男子單打冠軍。
2000年,悉尼奧運(yùn)會(huì)男子雙打亞軍。
1996年,亞特蘭大奧運(yùn)會(huì)男子雙打冠軍。
2005年,第48屆世乒賽男子雙打冠軍。
2003年,第47屆世乒賽男子雙打亞軍。
2001年,第46屆世乒賽男子單打亞軍。
2001年,第46屆世乒賽男子雙打亞軍。
2001年,第46屆世乒賽男子團(tuán)體冠軍。
2000年,第45屆世乒賽男子團(tuán)體亞軍。
1999年,第45屆世乒賽男子雙打冠軍。
1997年,第44屆世乒賽男子團(tuán)體冠軍。
1997年,第44屆世乒賽男子雙打冠軍。
1997年,第44屆世乒賽混雙亞軍。
1995年,第43屆世乒賽男子團(tuán)體冠軍。
1995年,第43屆世乒賽男子單打冠軍。
2002年,第23屆男子世界杯男子單打亞軍。
1997年,第18屆男子世界杯男子單打亞軍。
1995年,第16屆男子世界杯男子單打冠軍。
他非常固執(zhí),好的地方就是追求執(zhí)著,對(duì)事業(yè)很執(zhí)著。但他固執(zhí)的另一面,是一般的東西,他不太容易接受。我們有時(shí)候也很頭疼,有時(shí)候心里在罵街,恨不得,怎么這么不開(kāi)竅?(中國(guó)乒乓球隊(duì)總教練蔡振華評(píng))
我感覺(jué)他人比較固執(zhí),就是他認(rèn)準(zhǔn)的一樣?xùn)|西,你很難去改變他。(中國(guó)乒乓球男隊(duì)主教練劉國(guó)梁評(píng))
孔令輝的退役意味著一個(gè)時(shí)代的結(jié)束,不過(guò)退得太早了些,很惋惜啊。(前國(guó)家隊(duì)總教練許紹發(fā)評(píng))
輝哥是一個(gè)非常成功的乒乓球運(yùn)動(dòng)員,我希望他早點(diǎn)娶妻生子,在以后的事業(yè)上,同樣成為一個(gè)成功的男人。(中國(guó)男子乒乓球運(yùn)動(dòng)員王皓評(píng))
他平時(shí)是一個(gè)能扛,能沉得住氣,心里很有想法的人。(中國(guó)男子乒乓球運(yùn)動(dòng)員劉國(guó)正評(píng))